Юный Дзиро находит в собственном доме убитых мать и сестру. Ложно обвинённый в этом преступлении, он бежит из родной деревни и встречает священника по имени Тэнкай, который заставляет его убить отступника-ниндзя по имени Тародза. Выполнив это задание, Дзиро проходит обучение, чтобы стать мастером-убийцей. Спустя много лет Дзиро узнаёт, что он сирота, а его настоящим отцом был тот самый Тародза, работавший на Тэнкая, пока не бросил свою миссию, влюбившись в женщину из народа айнов. Юный ниндзя обнаруживает, что сёгунат намеревался найти утраченное сокровище Капитана Кидда и использовать его, чтобы вновь изолировать Японию от остального мира. Используя зашифрованные подсказки, которые тайно хранил Тародза, Дзиро вместе с девушкой-ниндзя Оюки и рабом по имени Сэм отправляются в Россию и Америку в поисках сокровища, надеясь с его помощью отомстить Тэнкаю.
