Благодаря технологиям профессора Юко Кодзуки и экстрасенсорным способностям Касуми Ясиро курсант Такэру Сироганэ возвращается в свой родной мир. Не теряя времени, Такэру рассчитывает на помощь Юко из этого мира, чтобы завершить проект «Alternative IV» — последнюю надежду человечества в борьбе с БЕТА, инопланетным видом, вторгшимся на планету. Проект по борьбе с БЕТА близится к завершению, и Такэру вместе с другими курсантами заканчивает пилотную академию Йокогамы.
Однако во время испытаний новой операционной системы для тактических боевых истребителей — гигантских боевых доспехов, которые человечество использует против своих противников, — БЕТА устраивают засаду на Такэру и его команду. Едва избежав смерти, Такэру оказывается травмирован, став свидетелем жестокой гибели одного из своих близких друзей.
Потеряв волю к борьбе, Такэру возвращается в другой мир, где ему приходится пережить похожую трагедию. Согласно теории Юко, людей из параллельных вселенных ждёт одна и та же судьба. Поэтому Такэру должен справиться со своей травмой, если хочет защитить тех, кто ему дорог.
