В недалёком будущем внезапное и необъяснимое повышение уровня моря привело к тому, что большая часть человеческой цивилизации оказалась под водой. Икаруга Нацуки, мальчик, потерявший мать и ногу в результате несчастного случая несколько лет назад, возвращается разочарованным из суровой жизни в большом городе и обнаруживает свой старый деревенский дом наполовину поглощённым морем.Оставшись без семьи, все, что у него есть — это корабль и подводная лодка, оставшиеся ему от бабушки-океанолога, и её долги. Единственная надежда вернуть утраченные мечты о будущем — воспользоваться возможностью, которую ему предоставляет подозрительная сборщица долгов Кэтрин. Они отправляются на поиски затонувших руин лаборатории его бабушки, чтобы найти сокровища, которые, по слухам, она там оставила. Но они находят не богатства или драгоценности, а странную девушку, спящую в гробу на дне моря.Атри — робот, но её внешность и богатство эмоций могут обмануть любого, приняв её за живого, дышащего человека. В благодарность за спасение она делает заявление Нацуки: «Я хочу выполнить последний приказ моего хозяина. А пока я этого не сделаю, я буду твоей ногой!»В маленьком городке, который постепенно омывает океан, начинается незабываемое лето для этого мальчика и этой загадочной девочки-робота.