Двадцать лет спустя город, ныне называемый «Токио», превратился в один из немногих мировых центров высоких технологий — «Токио-Сити». Главный герой, молодой следователь Кэн Кандзаки, служит в отделе уголовных расследований столичной полиции. Он один из лучших стрелков в полиции. Однажды Кэну поручают охранять праздник, устроенный мировой плутократией Zaizen Konzern.
Внезапно на празднике появляются роботы-призраки и срывают его. Главнокомандующий Дзайдзэн погибает, а Кэн и Дзюн, сын Дзайдзэна, получают от роботов смертельные ранения. Двое гостей праздника — автогонщик Рё Агури и борец Го Года — также получают тяжёлые ранения. Троих тяжелораненых юношей оперируют учёные столичной полиции. Несколько дней спустя отряд роботов, возглавляемый таинственной организацией «Идо», появляется в плавучем городе Токийского залива. Однако у полиции и армии нет действенной стратегии, чтобы сдержать их.
В этот момент появляются трое юношей в механических костюмах. Это те самые Кэн, Рё и Го, которые после операции стали киборгами-следователями. Они называют себя «Армированной Полицией Метал Джэк». «Метал Джэк», ослепительно превращаясь из «Джэк-костюмов» в «Джэк-броню», полностью уничтожают отряд роботов и одерживают победу, знаменуя тем самым начало битвы между высокотехнологичными преступниками и «Метал Джэк» на фоне футуристического «Токио-Сити».
