Второй сериал в «Виртуальной трилогии», сочетающий аниме и кадры игрового фильма.
Виртуальная станция — лаборатория, созданная для сбора и изучения ДНК. Благодаря информации, полученной при объединении элементов древней ДНК, древний мир был виртуально реконструирован. Юи — одна из генедайверов. Она отправляется в виртуальный древний мир, чтобы собирать ДНК животных, вымерших в реальности.
Но затем происходит инцидент. Во время цикла технического обслуживания Юи пытается покинуть виртуальный мир, однако вместо возвращения в реальность переносится в новое виртуальное настоящее. В этом новом мире, созданном вышедшей из-под контроля системой, существует разумный вид, произошедший от грызунов, — пуглайстиги. Они считают существование человечества серьёзной угрозой и пытаются остановить эволюцию людей любыми средствами.
