В фильме ниндзя Докута́кэ крадут у папы Синбэя груз селитры. Они планируют приготовить из неё лекарство, которое позволит им летать и превратит их в суперниндзя! Дандзо, чей отец перевозил груз, тайком пробирается в повозку и оказывается в тайной штаб-квартире Докута́кэ. Когда Синбэй сообщает обо всём в школу, Ямада-сэнсэй и Дои-сэнсэй спешат на помощь. Но Хагуми решает взять дело в свои руки и самостоятельно попытаться спасти Дандзо. Правда, всё идёт не по плану, и вскоре спасать приходится уже их самих. К счастью, рядом оказывается Рикити, крутой сын Ямада-сэнсэя, готовый помочь! На самом деле вскоре в это дело оказывается вовлечён каждый! Но смогут ли Рантаро и его друзья остановить Хаппосая, пока не стало слишком поздно?