Против своей воли принимала участие в эксперименте по повышению способностей эсперов до шестого уровня: её ДНК использовали для создания двадцати тысяч клонов, обладающих частью её способностей, для того, чтобы, убивая их, Акселератор, признанный единственным, кто был способен подняться до шестого уровня, развивал свои способности дальше. После того, как при содействии Томы — а также по причине разрушения спутника с суперкомпьютером «Древо диаграмм», — эксперимент был прерван, Мисака влюбилась в Тому.