Создан в результате эксперимента придворного алхимика царя Ксеркса, легендарного древнего города, из крови раба №23. В качестве благодарности дал рабу имя — Ван Хоэнхайм, а также научил его читать, писать, считать и обучил основам алхимии. Позже обманом заставил престарелого царя создать огромный круг преобразования вокруг Ксеркса, пообещав бессмертие. В результате Ксерскс был уничтожен, а Отец обрёл свободу. Полученные души он разделил с Хоэнхаймом. Когда тот бежал на восток, сам Отец отправился на запад. Там он стал известен как «Мудрец с Востока». На протяжении столетий был серым кардиналом Аместриса.
Ненавидит людей и, чтобы быть менее похожими на них, все семь смертных грехов «отделил от себя», поселив их в разные тела — так появились остальные гомункулы. Внешность точно такая же, как у Хоэнхайма. Однако настоящий его лик — это бесформенное существо, состоящие из тёмной материи, глаз и рта, то есть примерно такой же, как и у Гордыни или содержимого Врат.
В день затмения в Аместрисе активирует с помощью ценных жертв гигантский алхимических круг. Всё население страны, кроме тех, кто был в центре круга, становится материалом для равноценного обмена. Это преобразование открывает «Врата Земли», призывая «бога» (хотя Хоэнхайм уверен, что это не бог) на Землю, и поглощает его. После поглощения у Отца меняется внешность: его тело становится похожим на тело Эдварда Элрика или молодого Хоэнхайма, благодаря стараниям которого Отец лишился приобретённой силы всего через несколько минут. После этого его чуть не побеждают Хоэнхайм, Изуми Кёртис и братья Элрики, но он уходит на поверхность и пытается восполнить силы философского камня при помощи жизней солдат. В итоге он регенерирует тела людей Ксеркса с целью отвлечь Хоэнхайма, а затем обрушивает на него мощный поток энергии.
В 107-й главе манги исчерпывает весь запас философского камня и получает смертельные удары от Эдварда Элрика. В финале гомункул принимает свой настоящий облик. Затем его поглощает Истина.
