В изначальном ходе истории она заключила контракт с Кюбэем и сражалась вместе с остальными героинями. Однако в итоге погибла в бою с Вальпургиевой Ночью. Совершённые Хомурой путешествия во времени создали множество миров, центральной фигурой которых стала Мадока. Благодаря этому в итоге Мадока обрела огромный магический потенциал, чрезвычайно заинтересовавший Кюбэя. В варианте истории, на котором фокусируется сериал, Хомуре удаётся удерживать Мадоку от заключения контракта до самого появления Вальпургиевой Ночи. Однако в итоге она загадывает лично уничтожить всех ведьм как в будущем, так и в прошлом, и исчезает из Вселенной, став божеством, забирающим себе всю скорбь волшебниц до того, как они переродятся в ведьм.
