Во время экзамена на звание тюнина Шикамару оказался единственным из своей группы, кому удалось достигнуть финальной части. После того, как команда прошла первый (письменный) и второй (в лесу) испытания, в дополнительном раунде в виде боёв один на один Чоджи проиграл гэнину Деревни Звука, а Ино вместе с Сакурой были отстранены от дальнейшего участия. Шикамару же, победив Кин Цучи, прошёл дальше и в финальной части в бою встретился с Тэмари. Несмотря на преимущество, он в последний момент сдался.
Во II части, шокированный гибелью Асумы, он поставил перед собой цель отомстить его убийце. В итоге благодаря своим умственным способностям устроил ловушку Хидану и, взорвав его, заживо погрёб под тоннами земли.
Во время Четвёртой Мировой Войны Синоби вместе с товарищами по команде сражался сначала против Кинкаку, а потом против Асумы, воскрешённого с помощью «Эдо Тэнсэй». Позже вместе со всеми прибывает на помощь Наруто, Киллеру Би, Какаши и Майто Гаю. Чуть не погибает от того, что Джуби забрал его чакру, но благодаря Наруто и собственной стойкости (решает, что он нужен Наруто, когда тот станет Хокагэ, как советник) выживает.