В середине XXI века глобальное потепление превратило Токио в тропический город, а разрушительные шквалы сделали жизнь в нём невозможной. Правительство решило покинуть Токио и эвакуировать людей в гигантский многоуровневый мегаполис «Атлас», но ограниченная вместимость «Атласа» привела к появлению огромного числа беженцев и антиправительственных партизан. Ходзё Кунико, предводительница партизан, взялась за оружие и выступила против правительства, чтобы остановить проект «Атлас».
