История «Школьной лестницы» разворачивается в академии Тэнгурихама и рассказывает о главном герое, Юкихиро Канбе, который недавно поступил в эту школу после того, как его усыновил дядя. Однажды Юкихиро случайно встречает Юко Коконоэ, которая пробегает по лестнице у него за спиной, а затем быстро исчезает, спустившись вниз. После того как Юкихиро сталкивается с гимнастическим клубом, пытающимся завербовать его, но остановленным Юко, он оказывается вынужден вступить в «клуб лестниц» — нелегальный клуб, участники которого устраивают забеги по лестницам. Поначалу Юкихиро не хочет вступать в клуб из-за его дурной репутации среди учеников, однако вскоре находит его занятия захватывающими и решает присоединиться.
