Приближаются последние дни эпохи Эдо! Американский флот, известный как «Чёрные корабли», под командованием адмирала Мэтью Перри требует прекратить изоляционистскую политику сёгуната и открыть Японию для торговли с Западом. В последней попытке предотвратить войну главный советник сёгуна Абэ Масахиро поручает своим людям разыскать Сава́муру Дзиндзабуро — одного из последних синоби в стране.
Как постаревший ниндзя выполнит порученное ему тайное задание и докажет, что искусство синоби не устарело? Начинается новая история о последнем ниндзя!
