Действие «Кланнада» в основном происходит в старшей школе, расположенной в небольшом японском городе. «Кланнад» рассказывает о жизни Томои Окадзаки, ученика третьего года обучения, который не относится к учёбе всерьёз. Он ненавидит свой город и повседневную рутину, ожидая чего-то, что раскрасило бы его унылую жизнь. Вечно опаздывая на занятия, среди одноклассников он слывёт хулиганом — те заняты подготовкой к вступительным экзаменам в университет. Само собой, близких друзей у него тоже немного. Однажды по дороге в школу Томоя проходит мимо хрупкой девушки, тихо бормочущей себе под нос. Внезапно она восклицает: «анпан», — и привлекает его внимание. Между ними завязывается короткий разговор, после чего оба продолжают путь к школе.