В середине XXI века человеческая цивилизация оказалась в тяжёлом положении.
Генная технология завоевала огромный рынок, и из-за колоссальных прибылей исследования значительно ускорились. Ген «бессмертия» больше не казался несбыточной мечтой. Однако образец этого гена случайно смешался с биологически опасным веществом, в результате чего возникла новая форма жизни. «Они» также вобрали генетический материал из окружающей природы и превратились во врага, вторгшегося в мир людей.
Теперь шахелы способны разгромить человеческие вооружённые силы, и к этому моменту оба американских континента оказались под их контролем. США и многие другие страны исчезли с карты.
В Японии правительство создало и продолжает совершенствовать отряд «самураев» для борьбы с шахелами. В него входят солдаты, усиленные наномашинами, которые соединяют их с бронированными экзоскелетами.
Именно тогда Цукахара Такэмити назначают в 1-й взвод «Места самураев».