В эпоху Тэнсё юный Ватари и старик Дзи поселяются в деревне ниндзя Ига, где ниндзя разделены на две враждующие школы — Хякутти и Фудзибаяси. Главари каждой школы правят, угрожая смертью, и в конце концов те, кто желает изменить существующий порядок, образуют третью школу — Акамэ. Ватари и Дзи активно разоблачают мрачные заговоры, плетущиеся вокруг деревни Ига, пытаясь свергнуть деспотичных правителей-ниндзя.