Действие происходит в обычном японском городе Фуюки. Скрытая от общества, в этом городе идёт смертельная война. Семь магов, известных как «Мастера», призывают могущественных фамильяров, называемых «Слугами», и сражаются друг с другом, пока не останется последний. Считается, что последний получит Святой Грааль, который исполнит его желание. Лишь немногие знают, когда началась эта война и что такое Святой Грааль, но в этом году война должна была начаться вновь.
Главный герой — Эмия Сиро, потерявший родителей во время пожара и усыновлённый человеком, называвшим себя магом. Восхищаясь приёмным отцом, он тренировался, чтобы стать магом. Однако таланта у него не было, и он едва мог использовать один вид магии. Его приёмный отец уже умер, а сам он стал магом, не обладая ни навыками, ни знаниями. Он оказывается втянут в Войну за Святой Грааль, случайно призвав Сэйбер, которую считают сильнейшей из всех Слуг…
