Сюжет манги больше напоминает сюжет аниме и начинается с того, что Кодзи навещает своего деда после того, как барон Асура активировал бомбу. Перед смертью доктор Кобуто передаёт Кодзи суперробота «Мазингер Зет». Пока надвигается угроза со стороны доктора Хэла, Кодзи сражается с его механическими чудовищами и лейтенантами при помощи Саяки Юми и, в некоторой степени, Босса.
