«Чёрный Джек: Тёмный хирург» («Чёрный Джек — тёмный хирург») выходил в 2005 и 2006 годах. Это прямой ремейк оригинальной манги «Чёрный Джек»: оригинальные истории Осаму Тэдзуки были переписаны и перерисованы Кэндзи Ямамото в более современном стиле манги. Манга выходила в журнале «Сёнэн чемпион» — том же, где публиковались «Чёрный Джек: Элайв» и «Чёрный Джек: Нео». Всего вышло три тома (20 выпусков), а публикация завершилась 9 февраля 2006 года.