После того как террористический взрыв уносит жизнь его единственной дочери, известный биогенетик профессор Синигами соединяет её клетки с клетками её любимой при жизни розы. Когда роза оказывается почти уничтожена землетрясением, он также соединяет растение с клетками Годзиллы, собранными японским правительством для изучения после последнего нападения Короля монстров на Японию, чтобы сделать его бессмертным.
Те же террористы хотят заполучить G-клетки и угрожают вновь выпустить Годзиллу, если японское правительство не уступит их требованиям.
Вскоре Годзилла возвращается и направляется к генетически изменённому растению, которое тем временем мутировало в колоссальное чудовище по имени Биолланте!
