Человечество оказалось на грани исчезновения из-за вышедшей из-под контроля установки управления атмосферой и войны. Амагии Рэн, мальчик-«Маг», способный переписывать «информацию» о существовании и тем самым управлять даже законами физики, — подопытный, которого должны перевезти в город Кобэ, один из семи оставшихся в мире закрытых городов — «Сити».
Он получает просьбу забрать образец, но ему также мешает маг «Рыцарь» Юити Куросава, и в итоге Рэн возвращается лишь с девочкой по имени Фиа. Рэн и Юити сталкиваются друг с другом из-за людей, которых хотят защитить. Однако у Фии был серьёзный секрет, связанный с «Сити»…