В 220X году мир продвинулся в направлении радиоволновых технологий, и мир соединен волновой дорогой. Познакомьтесь с Субару Хосикава Хосикавой, учеником пятого класса, который потерял своего отца в космической катастрофе. Субару встречает внеземную радиоволну по имени Уор-Рок, спускающуюся с далекой планеты FM. Уор-Рок утверждает, что знает об отце Субару, но многие инопланетные существа охотятся за Уор-Роком. Эти двое работают вместе и сливаются в Мегамена, радиоволнового человека, способного преодолевать Волновую дорогу и сражаться с радиоволновыми вирусами и FMS, которые угрожают Земле.
